Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2IRD1Q9UHL9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms