Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APEX2Q9UBZ4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms