Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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COPS7AQ9UBW8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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COPS7AQ9UBW8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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COPS7AQ9UBW8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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COPS7AQ9UBW8 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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COPS7AQ9UBW8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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COPS7AQ9UBW8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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COPS7AQ9UBW8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
COPS7AQ9UBW8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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