Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL13Q9P2N7 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL13Q9P2N7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL13Q9P2N7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL13Q9P2N7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL13Q9P2N7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL13Q9P2N7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL13Q9P2N7 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL13Q9P2N7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL13Q9P2N7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL13Q9P2N7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL13Q9P2N7 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL13Q9P2N7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL13Q9P2N7 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL13Q9P2N7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL13Q9P2N7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL13Q9P2N7 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL13Q9P2N7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL13Q9P2N7 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL13Q9P2N7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL13Q9P2N7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL13Q9P2N7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL13Q9P2N7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL13Q9P2N7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL13Q9P2N7 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms