Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.05■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL42Q9P2K6 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms