Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COMMD8Q9NX08 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms