Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD7

RXFP3, Relaxin-3 receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXFP3Q9NSD7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RXFP3Q9NSD7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RXFP3Q9NSD7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms