Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA38

ZMAT3, Zinc finger matrin-type protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMAT3Q9HA38 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZMAT3Q9HA38 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms