Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFDQ9GZP0 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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