Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms