Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC4A5Q9BY07 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC4A5Q9BY07 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms