Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF17Q9BXT8 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms