Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL3Q9BXA9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms