Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms