Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms