Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms