Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COG3Q96JB2 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms