Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PGAP3Q96FM1 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAP3Q96FM1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAP3Q96FM1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAP3Q96FM1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAP3Q96FM1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAP3Q96FM1 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAP3Q96FM1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAP3Q96FM1 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAP3Q96FM1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAP3Q96FM1 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAP3Q96FM1 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAP3Q96FM1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAP3Q96FM1 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAP3Q96FM1 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAP3Q96FM1 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAP3Q96FM1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAP3Q96FM1 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAP3Q96FM1 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAP3Q96FM1 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAP3Q96FM1 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAP3Q96FM1 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAP3Q96FM1 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAP3Q96FM1 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PGAP3Q96FM1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms