Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CHFRQ96EP1 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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