Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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