Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RUNDC1Q96C34 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms