Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms