Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms