Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C11orf40Q8WZ69 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms