Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBLCP1Q8WVY7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms