Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms