Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms