Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL3Q8IVW4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms