Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms