Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms