Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSSK4Q6SA08 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms