Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD40Q6AI12 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms