Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRRT3Q5FWE3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT3Q5FWE3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms