Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RPL39P5Q59GN2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms