Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms