Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms