Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
KRTAP20-2Q3LI61 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
KRTAP20-2Q3LI61 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms