Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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