Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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