Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IMPG1Q17R60 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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