Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
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