Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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