Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NRF1Q16656 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms