Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms