Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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SSX1Q16384 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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SSX1Q16384 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SSX1Q16384 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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