Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP13Q15645 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms