Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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SS18Q15532 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SS18Q15532 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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SS18Q15532 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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SS18Q15532 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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SS18Q15532 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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SS18Q15532 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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SS18Q15532 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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SS18Q15532 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SS18Q15532 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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