Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TLR1Q15399 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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