Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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