Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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PTPRRQ15256 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PTPRRQ15256 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PTPRRQ15256 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRRQ15256 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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